Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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GEN1Q17RS7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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GEN1Q17RS7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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GEN1Q17RS7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GEN1Q17RS7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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