Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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RTN1Q16799 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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RTN1Q16799 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTN1Q16799 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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