Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDKN3Q16667 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CDKN3Q16667 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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