Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
FXNQ16595 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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FXNQ16595 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FXNQ16595 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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FXNQ16595 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FXNQ16595 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FXNQ16595 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FXNQ16595 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FXNQ16595 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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FXNQ16595 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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FXNQ16595 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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FXNQ16595 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FXNQ16595 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FXNQ16595 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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FXNQ16595 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FXNQ16595 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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FXNQ16595 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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FXNQ16595 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FXNQ16595 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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