Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC18A3Q16572 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms