Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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RPE65Q16518 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPE65Q16518 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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