Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TAF1AQ15573 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TAF1AQ15573 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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