Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TAF11Q15544 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms