Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEC23BQ15437 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms