Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRAM2Q15035 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms