Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LAPTM4AQ15012 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LAPTM4AQ15012 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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