Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMC1AQ14683 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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