Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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SPIDRQ14159 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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SPIDRQ14159 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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SPIDRQ14159 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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SPIDRQ14159 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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SPIDRQ14159 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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SPIDRQ14159 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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SPIDRQ14159 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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SPIDRQ14159 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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SPIDRQ14159 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPIDRQ14159 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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