Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CBFBQ13951 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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