Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ATP1A4Q13733 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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