Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ITGA7Q13683 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms