Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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CUL4AQ13619 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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CUL4AQ13619 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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CUL4AQ13619 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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CUL4AQ13619 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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CUL4AQ13619 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CUL4AQ13619 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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