Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

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Length 666 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CAMK2BQ13554 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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