Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTBP1Q13363 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms