Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHAF1AQ13111 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHAF1AQ13111 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
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