Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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TRAF2Q12933 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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TRAF2Q12933 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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TRAF2Q12933 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF2Q12933 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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