Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SREBF2Q12772 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SREBF2Q12772 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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