Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
NUP160Q12769 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NUP160Q12769 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
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