Protein–RNA interactions for Protein: Q10472

GALNT1, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT1Q10472 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GALNT1Q10472 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms