Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms