Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CGNL1Q0VF96 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms