Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RASGEF1BQ0VAM2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms