Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELP6Q0PNE2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms