Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNB2Q08289 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNB2Q08289 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms