Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SRSF4Q08170 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms