Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CDK18Q07002 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms