Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LTBQ06643 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LTBQ06643 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LTBQ06643 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms