Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UBE3AQ05086 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UBE3AQ05086 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms