Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ERCC6Q03468 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ERCC6Q03468 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms