Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PLOD1Q02809 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms