Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DSC2Q02487 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DSC2Q02487 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms