Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC6A3Q01959 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC6A3Q01959 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms