Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN7AQ01118 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCN7AQ01118 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCN7AQ01118 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN7AQ01118 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCN7AQ01118 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCN7AQ01118 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCN7AQ01118 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCN7AQ01118 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN7AQ01118 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN7AQ01118 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN7AQ01118 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCN7AQ01118 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCN7AQ01118 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SCN7AQ01118 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN7AQ01118 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN7AQ01118 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN7AQ01118 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCN7AQ01118 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN7AQ01118 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms