Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXC5Q00444 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms