Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TFAMQ00059 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TFAMQ00059 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms