Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMF1P82094 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMF1P82094 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMF1P82094 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMF1P82094 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMF1P82094 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMF1P82094 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMF1P82094 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMF1P82094 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMF1P82094 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMF1P82094 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMF1P82094 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMF1P82094 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMF1P82094 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMF1P82094 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMF1P82094 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMF1P82094 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMF1P82094 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMF1P82094 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMF1P82094 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMF1P82094 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMF1P82094 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMF1P82094 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMF1P82094 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMF1P82094 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMF1P82094 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMF1P82094 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMF1P82094 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMF1P82094 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMF1P82094 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms