Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NOMO3P69849 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms