Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ACTA2P62736 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ACTA2P62736 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms