Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HERVK_113P62684 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms