Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
RPS29P62273 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
RPS29P62273 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
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