Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
UFM1P61960 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UFM1P61960 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UFM1P61960 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UFM1P61960 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UFM1P61960 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UFM1P61960 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UFM1P61960 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UFM1P61960 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UFM1P61960 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UFM1P61960 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UFM1P61960 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms