Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MCCD1P59942 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms