Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B3P54709 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B3P54709 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP1B3P54709 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP1B3P54709 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP1B3P54709 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP1B3P54709 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP1B3P54709 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP1B3P54709 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP1B3P54709 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP1B3P54709 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP1B3P54709 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP1B3P54709 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATP1B3P54709 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms