Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC25A1P53007 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms