Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC4A3P48751 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC4A3P48751 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms